Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms