Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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