Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDR42E2A6NKP2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms