Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CFAP73A6NFT4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CFAP73A6NFT4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CFAP73A6NFT4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CFAP73A6NFT4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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