Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EME2A4GXA9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms