Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TARSL2A2RTX5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TARSL2A2RTX5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms