Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX5Q9Y5X3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms