Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX10Q9Y5X0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms