Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC1Q9Y5R8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms