Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSAG2Q9Y5P2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSAG2Q9Y5P2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms