Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF1Q9Y548 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YIPF1Q9Y548 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms