Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ4Q9Y3A0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COQ4Q9Y3A0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms