Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIK3Q9Y2K2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIK3Q9Y2K2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms