Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLEC11AQ9Y240 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC11AQ9Y240 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC11AQ9Y240 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms