Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVW-1Q9UQF0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVW-1Q9UQF0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms