Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN8AQ9UQD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN8AQ9UQD0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms