Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEU3Q9UQ49 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEU3Q9UQ49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms