Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRAK1Q9UPV9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAK1Q9UPV9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRAK1Q9UPV9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms