Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
L1RE1Q9UN81 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1RE1Q9UN81 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms