Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML1Q9UN30 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCML1Q9UN30 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms