Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI4Q9UM07 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms