Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DENND2AQ9ULE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms