Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH7Q9ULB5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH7Q9ULB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms