Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCOLCE2Q9UKZ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms