Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRTO4Q9UKD2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRTO4Q9UKD2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms