Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GGA1Q9UJY5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GGA1Q9UJY5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms