Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX2Q9UIW0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAX2Q9UIW0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms