Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCMT1Q9UIC8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCMT1Q9UIC8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCMT1Q9UIC8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms