Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA3Q9UI47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNA3Q9UI47 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNA3Q9UI47 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA3Q9UI47 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms