Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DBF4Q9UBU7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DBF4Q9UBU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
DBF4Q9UBU7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms