Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM8A1Q9UBU6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms