Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLKQ9UBE8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLKQ9UBE8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLKQ9UBE8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms