Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
REREQ9P2R6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
REREQ9P2R6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
REREQ9P2R6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
REREQ9P2R6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms