Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP28Q9P2N2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms