Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCOR3Q9P2K3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCOR3Q9P2K3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms