Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRBP1Q9P2E9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
RRBP1Q9P2E9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RRBP1Q9P2E9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms