Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCDH10Q9P2E7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDH10Q9P2E7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDH10Q9P2E7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms