Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNKQ9P0W0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNKQ9P0W0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNKQ9P0W0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms