Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L1Q9P0L9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2L1Q9P0L9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms