Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMCD1Q9NZU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms