Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMOD2Q9NZR1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD2Q9NZR1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD2Q9NZR1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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