Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYOFQ9NZM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYOFQ9NZM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYOFQ9NZM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms