Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX43Q9NXZ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms