Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM9Q9NXL9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM9Q9NXL9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM9Q9NXL9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms