Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A12Q9NXJ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms