Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOR4AQ9NXH8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOR4AQ9NXH8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms