Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH5Q9NX47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH5Q9NX47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH5Q9NX47 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms