Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT57Q9NWB7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
IFT57Q9NWB7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT57Q9NWB7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms