Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO28Q9NVF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms