Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms